MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.04

Total Repeats: 902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019761	A	7	7	25966	25972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019761	AC	3	6	25976	25981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_019761	GGC	2	6	26202	26207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314574
504	NC_019761	CCT	2	6	26252	26257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314575
505	NC_019761	G	8	8	26338	26345	0 %	0 %	100 %	0 %	428314575
506	NC_019761	GAC	2	6	26382	26387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314575
507	NC_019761	ATTG	2	8	26416	26423	25 %	50 %	25 %	0 %	428314575
508	NC_019761	AC	3	6	26445	26450	50 %	0 %	0 %	50 %	428314575
509	NC_019761	TACCT	2	10	26512	26521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
510	NC_019761	T	6	6	26540	26545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019761	GA	3	6	26553	26558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019761	T	8	8	26626	26633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019761	ACC	2	6	26726	26731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_019761	TA	3	6	26827	26832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019761	GGA	2	6	26845	26850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019761	T	6	6	26868	26873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019761	ACAA	2	8	26927	26934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_019761	ACC	2	6	26970	26975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_019761	TTC	2	6	26984	26989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_019761	CAA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_019761	CCAT	2	8	27103	27110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_019761	ACC	2	6	27135	27140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_019761	TCT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_019761	CAAC	2	8	27437	27444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_019761	CAG	2	6	27526	27531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019761	TGG	2	6	27635	27640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019761	TGA	2	6	27652	27657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314576
528	NC_019761	CTGA	2	8	27801	27808	25 %	25 %	25 %	25 %	428314576
529	NC_019761	CA	3	6	27831	27836	50 %	0 %	0 %	50 %	428314576
530	NC_019761	TGG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314576
531	NC_019761	GCG	2	6	27859	27864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314576
532	NC_019761	ACC	2	6	28143	28148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314576
533	NC_019761	GGCT	2	8	28244	28251	0 %	25 %	50 %	25 %	428314576
534	NC_019761	GGC	2	6	28281	28286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314576
535	NC_019761	CAA	2	6	28464	28469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314576
536	NC_019761	TGA	2	6	28520	28525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314576
537	NC_019761	TCG	2	6	28646	28651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314576
538	NC_019761	GTT	2	6	28743	28748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314576
539	NC_019761	TCA	2	6	28783	28788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314576
540	NC_019761	ATT	2	6	28962	28967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314576
541	NC_019761	CCT	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314576
542	NC_019761	CGTT	2	8	29164	29171	0 %	50 %	25 %	25 %	428314576
543	NC_019761	ACACC	2	10	29230	29239	40 %	0 %	0 %	60 %	428314576
544	NC_019761	CTGGT	2	10	29242	29251	0 %	40 %	40 %	20 %	428314576
545	NC_019761	AG	3	6	29399	29404	50 %	0 %	50 %	0 %	428314576
546	NC_019761	GCT	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314576
547	NC_019761	A	6	6	29704	29709	100 %	0 %	0 %	0 %	428314576
548	NC_019761	TGAG	2	8	29755	29762	25 %	25 %	50 %	0 %	428314576
549	NC_019761	GCT	2	6	29895	29900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314576
550	NC_019761	GAG	2	6	29910	29915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314576
551	NC_019761	TAA	2	6	30074	30079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314576
552	NC_019761	GGGTGA	2	12	30242	30253	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428314576
553	NC_019761	GTTAGG	2	12	30284	30295	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428314576
554	NC_019761	ATT	2	6	30468	30473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314576
555	NC_019761	ACA	2	6	30660	30665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314576
556	NC_019761	CACG	2	8	30703	30710	25 %	0 %	25 %	50 %	428314576
557	NC_019761	TAA	3	9	30712	30720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314576
558	NC_019761	C	6	6	30745	30750	0 %	0 %	0 %	100 %	428314576
559	NC_019761	GGA	2	6	30836	30841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314576
560	NC_019761	GCG	2	6	30846	30851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314576
561	NC_019761	AAC	2	6	30855	30860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314576
562	NC_019761	AGC	2	6	30883	30888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314576
563	NC_019761	AGG	2	6	31102	31107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314577
564	NC_019761	TC	3	6	31117	31122	0 %	50 %	0 %	50 %	428314577
565	NC_019761	TTG	2	6	31155	31160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314577
566	NC_019761	CCAG	2	8	31376	31383	25 %	0 %	25 %	50 %	428314577
567	NC_019761	TGA	2	6	31612	31617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314577
568	NC_019761	CTGC	2	8	31653	31660	0 %	25 %	25 %	50 %	428314577
569	NC_019761	A	6	6	31706	31711	100 %	0 %	0 %	0 %	428314577
570	NC_019761	ACATTG	2	12	31976	31987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_019761	C	6	6	31989	31994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
572	NC_019761	CCTAA	2	10	32014	32023	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
573	NC_019761	CGC	2	6	32109	32114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314579
574	NC_019761	C	6	6	32145	32150	0 %	0 %	0 %	100 %	428314579
575	NC_019761	GTT	2	6	32366	32371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314579
576	NC_019761	CTT	2	6	32408	32413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_019761	AAG	2	6	32454	32459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019761	GGACA	2	10	32461	32470	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
579	NC_019761	CAG	2	6	32549	32554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_019761	TCT	3	9	32574	32582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_019761	GATT	2	8	32756	32763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019761	AAG	2	6	32781	32786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019761	ATCC	2	8	32860	32867	25 %	25 %	0 %	50 %	428314580
584	NC_019761	GTG	2	6	33015	33020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314580
585	NC_019761	TTC	2	6	33158	33163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314580
586	NC_019761	TGA	2	6	33170	33175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314580
587	NC_019761	GGTCA	2	10	33193	33202	20 %	20 %	40 %	20 %	428314580
588	NC_019761	TGC	2	6	33221	33226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314580
589	NC_019761	GCT	2	6	33246	33251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314580
590	NC_019761	AAAT	2	8	33298	33305	75 %	25 %	0 %	0 %	428314580
591	NC_019761	GAT	2	6	33321	33326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314580
592	NC_019761	AGTTC	2	10	33366	33375	20 %	40 %	20 %	20 %	428314580
593	NC_019761	TTCAA	2	10	33396	33405	40 %	40 %	0 %	20 %	428314580
594	NC_019761	AAC	2	6	33415	33420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314580
595	NC_019761	CAA	2	6	33453	33458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314580
596	NC_019761	TGG	2	6	33523	33528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314580
597	NC_019761	TCC	2	6	33545	33550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314580
598	NC_019761	TGG	2	6	33560	33565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314580
599	NC_019761	ACA	2	6	33623	33628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314580
600	NC_019761	AAG	2	6	33668	33673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314580
601	NC_019761	TC	4	8	33714	33721	0 %	50 %	0 %	50 %	428314580
602	NC_019761	TGA	2	6	33740	33745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314580
603	NC_019761	AGTT	2	8	33757	33764	25 %	50 %	25 %	0 %	428314580
604	NC_019761	CTG	2	6	33808	33813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314580
605	NC_019761	AGA	2	6	33823	33828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314580
606	NC_019761	CTG	3	9	33904	33912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314580
607	NC_019761	ACT	2	6	33915	33920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314580
608	NC_019761	A	6	6	33963	33968	100 %	0 %	0 %	0 %	428314580
609	NC_019761	CTC	2	6	33983	33988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314580
610	NC_019761	TGA	2	6	34112	34117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314580
611	NC_019761	TGT	2	6	34132	34137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314580
612	NC_019761	ATT	2	6	34233	34238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314580
613	NC_019761	ATT	2	6	34245	34250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314580
614	NC_019761	CCT	2	6	34257	34262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314580
615	NC_019761	TCC	2	6	34271	34276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314580
616	NC_019761	CTT	2	6	34311	34316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314580
617	NC_019761	CTAA	2	8	34333	34340	50 %	25 %	0 %	25 %	428314580
618	NC_019761	GGTA	2	8	34343	34350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019761	AT	3	6	34435	34440	50 %	50 %	0 %	0 %	428314581
620	NC_019761	CAA	2	6	34589	34594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314581
621	NC_019761	GAG	2	6	34599	34604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314581
622	NC_019761	GAA	2	6	34658	34663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314581
623	NC_019761	TTG	2	6	34686	34691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314581
624	NC_019761	TGAAG	2	10	34706	34715	40 %	20 %	40 %	0 %	428314581
625	NC_019761	TGG	2	6	34741	34746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314581
626	NC_019761	TGT	2	6	34844	34849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314581
627	NC_019761	TAC	2	6	34885	34890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314581
628	NC_019761	TGGG	2	8	34892	34899	0 %	25 %	75 %	0 %	428314581
629	NC_019761	CCT	2	6	34923	34928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314581
630	NC_019761	GCT	3	9	34997	35005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314582
631	NC_019761	GCT	2	6	35024	35029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314582
632	NC_019761	GGCATT	2	12	35074	35085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314582
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720	NC_019761	ACC	2	6	39819	39824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314583
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732	NC_019761	ACA	3	9	40517	40525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314584
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755	NC_019761	CCA	2	6	41781	41786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314584
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